二者的區別主要還是體現在補償上面，原因就是棚改基本都是針對城鎮房屋，危改則是普遍針對農村房屋，而改造的方式都是大同小異；

棚戶區改造應如何補償呢？

一般來講，對于國有土地上的棚戶區改造，房屋補償應當由具有相應資質的房地產價格評估機構按照房屋征收評估辦法評估確定。補償可以參考就近區位類似結構的商品房的價格。而補償方式通常分為貨幣補償和產權調換兩種。貨幣補償包括被征收房屋價值補償、搬遷費、臨時安置費、停產停業損失補償費、外遷補助費、其他補助費等。而產權置換一般是拆一還一，在同等區位中，能做到1:1進行房屋置換就算是合理補償。這兩種拆遷補償方式，被拆遷人可以自由選擇。

集體土地上房屋的棚戶區拆遷補償，通常也是分為貨幣補償和產權調換兩種方式。如果棚改區域是農村集體土地，但該片區處于城市規劃區范圍之內，則也可以參考國有土地上房屋的征收補償標準進行補償。產權調換也可以參照國有土地上房屋征收產權置換的標準。

危房改造補助對象

根據住房城鄉建設部、財政部、國務院扶貧辦《關于加強和完善建檔立卡貧困戶等重點對象農村危房改造若干問題的通知》，中央支持的農村危房改造對象為以下4類重點對象：

(1)建檔立卡貧困戶(建檔立卡貧困戶身份識別以扶貧部門認定為準);

(2)低保戶(貧困戶身份識別以民政部門認定為準);

(3)農村分散供養特困人員(農村分散供養特困人員身份識別以民政部門認定為準);

(4)貧困殘疾人家庭(貧困殘疾人家庭身份識別應由殘聯商或民政部門聯合認定為準);

其中危房是指依據《農村危險房屋鑒定技術導則(試行)》鑒定屬于整棟危房(D級)，或者局部危險(C級)的房屋。

補助標準

各地根據當地農村經濟社會發展水平和財力狀況的實際出發，參考農村危房改造方式、成本需求、補助對象自籌資金能力，合理確定補償標準。

例如2016年中央補助標準為戶均7500元，2017年中央補助標準提高到1.4萬元;在此基礎上對邊境縣、邊境一線貧困農戶、建筑節能示范戶每戶再增加2000元補助。